Šolsko delo se v Ljubljani odvija v naslednjih bolnišnicah:
- na Pediatrični kliniki,
- na Ortopedski kliniki (otroški oddelek),
- na Dermatovenerološki kliniki (otroški oddelek),
- na Univerzitetnem rahabilitacijskem inštitutu – URI Soča,
- na Enoti adolescentne psihiatrije Psihiatrične klinike v Ljubljani,
- na Oddelku za motne hranjenja Psihiatrične klinike v Ljubljani,
- na Oddelku za psihoze Psihiatrične klinike,
- na Centru za klinično psihiatrijo (CKP) Polje,
- na Infekcijski kliniki (občasno).
Poučujemo tudi šolarje, ki v bolnišnično šolo prihajajo od doma, ko tako presodi zdravnik. Obolele in bolne šolarje poučujemo tudi na njihovem domu (praviloma tak pouk izvajajo sicer matične šole posameznih učencev).